“三公六部”中，既論功行賞，又平衡各方勢力；既安排了實權職位，又留出大量空白，為日後的進步留出了足夠空間。
“三公”空缺兩個，分別為文官之首的丞相，與武官之首的太尉。實授的御史大夫，卻沒有多少實權；
“六部”尚書全部空缺，給未來留足了空間。封賞了五位侍郎來代理，類似於後世的“主持工作”。
“主持工作”有著較強的中國特色，飽含著中國智慧。無論在歷史上，還是後世現代社會；無論是體制內，還是公司內，都大量存在。
正所謂“花未全開月未圓，尋花待月思依然。明知花月無情物，若使多情更可憐。”
這種形勢下，副職必須承擔正職一樣的職責和任務，但是卻沒有正職應有的地位與尊榮；時刻讓副職看到晉升的希望，鞭策自己不斷地努力。
中央一級的行政架構中，有晉國家臣一人：端木仲敖；有魏國舊識一人：衛鞅；有韓國舊屬一人：羊圖；有墨家弟子三人：管黔滶、許犯、田系；有蜀國降臣一人：別元邦；有巴國降臣一人：相作符。
總體上做到了對各方勢力的相互制衡與制約。墨家弟子佔有三部侍郎之職，屬於最大贏家，這也凸顯出在種田過程中，專業技術人才的寶貴與重要。
封賞完“三省六部”，接下來是“四郡”郡守、郡尉、郡監。
郡守，為一郡最高行政長官，掌全郡政務，直接受中央政府節制，是名副其實的封疆大吏，必須使用信得過的人；
郡尉，輔佐郡守，掌管全郡軍事。屬於地方軍事長官，與中央常備軍不可同日而語。
郡守郡尉分設，也防止了封疆大吏掌控軍隊，形成割據；
郡監，掌監察工作，監督郡守郡尉的日常工作，雖不分管政務軍事，但有風聞奏事的權力，可以直接向君主彈劾彙報。
一、南鄭郡
封吳耕為南鄭郡守兼南鄭郡尉，全面負責南鄭的軍政工作。封墨家跌鼻為南鄭郡監。
之所以將吳耕封到南鄭郡，並且還郡守、郡尉軍政“一肩挑”，一是因為吳耕有功，二是吳耕忠心，三是吳耕能打，四是吳耕還有個重要的任務——隨時準備東出，接應堂哥吳起。
南鄭為什麼必須“一肩挑”？因為此地太重要了。目前巴蜀成了新政權的大本營，南鄭就成了入蜀的門戶。
所謂“守巴蜀必守南鄭”，南鄭一失，蜀地門戶大開。是故必在交通、通訊都不發達的戰國，必須賦予郡守絕對的權力。
吳耕今日的地位，像極了後世三國時的魏延。
二、吐費郡
吐費郡就是後世的廣元市一帶，本應歸入蜀郡，但從吐費城到巴蜀，中間有一個天險劍門關，以劍門為分割，可以形成不同的防區，方便管理。
另外，也算是作出對符溪瀟以及氐人的安撫姿態。
封符溪瀟為吐費郡守，封墨家索盧參為吐費郡尉，封墨家耕柱子為吐費郡監。
索盧參是俱酒的救命恩人，出場很早，但在巴蜀戰爭期間，主要負責南鄭大後方的防務，出場機會不多，立功不夠，暫時在郡尉位置上過渡一下。
耕柱子曾經擔任過楚國的地方官，有一定的治理經驗，由墨家二子共同鎮守，吐費郡以及氐人應該翻不了天。
三、巴郡
封樊紫金為巴郡守，封丁季為巴郡尉，封冶徒娛為巴郡監。
樊紫金獻城投降，是把末代巴王作為棋子，為自身爭取利益；這和別元邦一心為小蜀王爭取利益不可同日而語。是故同是獻城，別元邦高居三公之列，樊紫金卻不能。
當然還有一個原因，別元邦在平定西南諸洞，組建邦軍伐巴過程中，均有功勞。
儘管俱酒不待見此人，但是樊紫金獻城還是有大功的，必須賞罰分明。封其為巴郡郡守，相當於巴王的行政權力全部給了他，也算是對得起他獻出江州的功勞了。
丁季為俱酒在襄城的老人，忠誠絕對沒有問題，而且長期在淳于浩的水師中擔任副將，有豐富的作戰經驗。
巴郡的軍事防務，主要是長江防線，必須有一個精通水戰的將領來統領，是故丁季任郡尉，手握巴郡軍權，完全沒有問題。
再加上墨家的冶徒娛作為郡監，隨時向中央報告資訊，巴郡不會有事。
巴國五姓中的瞫氏，俱酒封其為閬中令，負責北部山區的治理。瞫氏歸附較晚，功勞也不顯。之前一直在大巴山的密林中討生活，此次能夠到閬中這個風水寶地，也算是格外開恩了。
四、蜀郡
這是俱酒最大的地盤，也是巴蜀的糧倉之地，更是未來統一天下的大本營，俱酒做出了超常規的豪華安排。
右丞相衛鞅繼兼任吏部尚書之，再挑重擔，繼續兼任蜀郡郡守。